Assembly Einstellung

_images/AssemblySettings.png

Modus(Mode) [1] (Erfordlich)

Ein Assember-Modus auszuwählen.

Bemerkung

  • Conservative: im Konservative-Modus wird das Assembly mit der geringsten Vollständigkeit und dem kleinsten Fehler erstellt.
  • Normal: im Normal-Modus wird das Assembly mit mittlerer Vollständigkeit und mittlerem Fehler erstellt.
  • Bold: im Grob-Modus wird das Assembly mit der höchsten Vollständigkeit und dem größten Fehler erstellt.
  • Standardwert: Normal.

Methode(Method) [1] (Erfordlich)

Eine Assember-Methode auszuwählen.

Bemerkung

  • Long-read-only assembly: mit der „Long-read-only assembly“-Methode werden nur die Nanopore-Reads zum Assembler gebracht.
  • Hybrid assembly: mir der „Hybrid assembly“-Methode werden Illumina-Reads und die Nanopore-Reads zum Assembler gebracht.
  • Standardwert: Hybrid assembly.
_images/AdvancedAssemblySettings.png

VCF [1] (Optional)

Eine VCF Datei wird erstellt, falls diese Option ausgewählt ist.

Bemerkung

  • Standardwert: nicht ausgewählt.
[1](1, 2, 3) Unicycler https://github.com/rrwick/Unicycler