Base Calling Einstellung

_images/BasecallingSettings.png

(Flowcell ID)Flowcell ID [2] (Erfordlich)

Eine Flowcell-ID aus der Liste auszuwählen.

(Kit Nummer)Kit Number [2] (Erfordlich)

Eine Kit-Nummer aus der Liste auszuwählen.

_images/AdvancedBasecallingSettings.png

(Modus)Mode (Erfordlich)

Guppy „Base Calling“ Modus einzustellen.

Bemerkung

  • Standardwert: high-accuracy.

Gerät(Device) (Erfordlich)

Das Sequenzier-Geräte einzustellen.

Bemerkung

  • Standardwert: PromethION.

cpu_threads_per_caller [1] (Standardwert)

Bemerkung

  • Standardwert: 1.

records_per_fastq [2] (Standardwert)

Bemerkung

  • Standardwert: 0.
  • Die Dateien werden per „Worker(CPU)“ und per „Run ID“ erstellt.

recursive [2] (Standardwert)

Bemerkung

  • Standardwert: die Eingabedateien werden rekursiv durchgesucht.
[1]Guppy v3.0.3 Release https://community.nanoporetech.com/posts/guppy-3-0-release
[2](1, 2, 3, 4) How to configure Guppy parameters https://community.nanoporetech.com/protocols/Guppy-protocol-preRev/v/gpb_2003_v1_revg_14dec2018/how-to-configure-guppy-parameters